El orden de los tipos de comprobante en la pantalla de facturación lo toma por Código.
Para organizar el orden de como se lista en la ventana de selección del tipo de factura que queremos hacer. Nos dirigimos a:
Configuración → Tipo de comprobante
Filtramos por el tipo de comprobante, Lo seleccionamos y presionamos en editar.
Cambiamos el código por el numero que va en el orden para que aparezca en la pantalla. Hacemos eso para todos los comprobantes y guardamos y reiniciamos el sistema para que tome los cambios.
Importante: no se puede cambiar los códigos de comprobantes legales (Factura A, Factura B, etc.) porque los usa para CITI venta y Libro de IVA digital.