Para que se vuelva a basar un comprobante en otro debemos a Configuración -> Tipos de comprobante y seleccionar el comprobante de origen, le damos a Editar.
Vamos a la solapa Basado y seleccionamos el comprobante en el que nos vamos a basar, le damos a Editar
Destildamos Actualiza comprobante en que se basa y le damos a Aceptar