Si el cliente desea hacerlo en un solo movimiento podemos editar el tipo de comprobante Egreso de Sucursal yendo a Configuración -> Tipos de Comprobante

Buscamos y seleccionamos «Remito de Egreso de Sucursal» y le damos a Editar

En el campo Movimiento Stock Destino seleccionamos Disminuye y le damos a Guardar

Listo, las transferencias a partir de ahora se hacen en un único movimiento